どんな一戸建てを? 
一口に一戸建てといっても建売もあれば注文住宅もありますね!
形態による注意点をあげてみました。
土地と建物をセットで購入
建物は既に出来上がっている又はプランが決まっている・・・・・・建売住宅
建築コストや販売コストを下げることができるため安価?
実際にはこれらのコストダウンがそのまま販売価格に反映されるといったことは少ないようです。

既に出来上がってしまった物件の場合 建築中の経過を確認できません。
住む人(購入者)の為に設計されているわけではないので間取りなど十分なチェックが必要でしょう。
土地と建物がセットだが建物は自由設計
建築条件付きなどの土地を購入するケース
「建築条件付き」の土地は基本的に土地の売買ですが、土地の契約後3ヶ月以内に売主かその代理人と建築の請負契約を結ぶ条件が付いています。
この間に請負契約がなされない場合土地の売買契約も無効になります。

建売住宅と違い建物は自由設計?ですが、3ヶ月という短い期間ということもあり実際には業者があらかじめ決めたプランの中から選ぶしかないケースも多いようです。
まったく自由な家を建てたいなら建築条件の付かない土地を購入したほうが良さそうです。
土地と建物を別々の業者で頼む
建物着工までに土地を取得しなければいけません。
土地代金を先に支払う為、資金計画に注意が必要です。

また購入しようとしている土地に建物が建っていたとしても地盤調査は必要です。
土地はあるので建物だけを頼む  今の家が古くなったので建てかえる
建物だけの事を考えればいいのですから少し楽ですね?
せっかく 自分たちに合わせて注文住宅を建てれるのですから、家族で良く話し合ってどんなマイホームがぴったりなのかを十分検討しましょう。
関連項目 一戸建ての工法 定期借地権付き住宅 地盤調査について

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